Расставим знаки препинания.

1) Учитель наш слыл радикалом и бранил за легкомыслие не только Пифагора, но даже Лейбница и Ньютона. − Запятая при однородных дополнениях.

2) Семён Иванович брал по порциям или одни щи с пирогом, или одну говядину. − Запятая при однородных дополнениях.

3) Трактирщик то помогал некоторым, то отбегал в сторону и всё командовал, критиковал. − Запятые при однородных сказуемых.

4) В комнате Риты окна были открыты настежь и пахло яблоками. − Запятая не ставится между основами, потому что есть общий второстепенный член − обстоятельство.

5) Мать положила в мешок хлеба, и соли, и сахара. − Запятые при однородных, связанных повторяющимся союзом И.

Ответ: 12|21.